CÔNG TY CỔ PHẦN CẤP THOÁT NƯỚC PHÚ YÊN tiền thân là CÔNG TY CẤP NƯỚC PHÚ YÊN được thành lập vào tháng 9/1996. Đến tháng 12/2005 Công ty Cấp thoát nước Phú Yên được chuyển đổi thành CÔNG TY TNHH MTV CẤP THOÁT NƯỚC PHÚ YÊN. Đến ngày 10/11/2015 CÔNG TY TNHH MTV CẤP THOÁT NƯỚC PHÚ YÊN chuyển đổi thành CÔNG TY CỔ PHẦN CẤP THOÁT NƯỚC PHÚ YÊN.
Lĩnh vực hoạt động chủ yếu là sản xuất-cung ứng nước sạch cho các đô thị và các Khu Công nghiệp trên địa bàn toàn Tỉnh và quản lý khai thác, duy tu hệ thống thoát nước thành phố Tuy Hoà. Hiện nay Công ty Cổ phần Cấp thoát nước Phú Yên đang quản lý và cung ứng nước sạch cho Thành phố Tuy Hoà, Thị xã Sông Cầu, 06 Thị trấn trong Tỉnh (TT La Hai-Huyện Đồng Xuân, TT Chí Thạnh-Huyện Tuy An, TT Củng Sơn-Huyện Sơn Hòa, TT Hai Riêng-Huyện Sông Hinh, TT Phú Hoà-Huyện Phú Hòa, TT Hòa Vinh và Trạm Cấp nước Vũng Rô-Huyện Đông Hòa) và 03 Khu Công nghiệp (Hoà Hiệp, An Phú và Đông Bắc Sông Cầu).